先糾正一個常識錯誤，正常的人瞳孔都為圓形，黑色透明，兩側等大，直徑約2.5毫米，對，你沒看錯，瞳孔的確不分人種都是黑色透明的，所謂的顏色差異是【虹膜】的顏色差異。
人類虹膜的基色只有三種：褐色、藍色和綠色。其他顏色的虹膜則是這三種顏色的變體。藍虹膜的人們其實并不具備藍色的眼睛色素，他們只是擁有的色素比其他人少一些，結果就留下了顏色偏藍的外在印象。
如果你的瞳孔周圍是一圈深褐色的虹膜，那就意味著在你的虹膜的最外面一層，擁有大量的黑色素。
如果這一層的黑色素較少，色素更多地分布在虹膜的深層，那你的眼睛可能是灰色的，也可能隨著色素數量的減少，依次向淺褐色、綠色、灰白色、藍色轉變。
有兩種比較特殊的眼睛。紫色的眼睛(參考伊麗莎白·泰勒)則是因為虹膜中黑色素的量很少，以致于無法掩蓋血液的顏色。
白化癥患者則有粉紅色虹膜，這是由于其虹膜中沒有色素，只能顯示出微血管的顏色。
根據基因研究而推斷的虹膜顏色形成原因，可見深棕、淺棕和灰色都是由黑色素的濃淡而引起，藍色是因為散射而產生的色彩，而紅色是因為白化而產生的色彩。當淺棕與藍色混合，成為了綠色；而紅色與藍色混合，則成為了紫色。
所以說，人類眼睛的各種顏色從本質上看都是某種光學假象，它所反映的正是黑色素在某種程度上的缺失。綠色虹膜在歐洲的凱爾特人、日耳曼人和斯拉夫人中比例較高；歐洲以外，一些普什圖人、土耳其人也有綠色虹膜。古代吉爾吉斯人也是。
